Sechs Jahre sind seit den Geschehnissen aus Digimon Adventure vergangen. Taichi und die anderen gehen mittlerweile auf die Oberschule und müssen sich mit den alltäglichen Teenagerproblemen rumschlagen. Alles könnte mehr oder weniger einfach sein – würden nicht plötzlich Digimon in der realen Welt auftauchen und alles in Schutt und Asche legen. Was hat es mit ihnen auf sich und können die Digiritter ihre Welt und die Digiwelt ein weiteres Mal retten?